De interne kracht en zwakten, en de externe kansen en bedreigingen die in een SWOT zijn weergegeven kunnen met elkaar in verband worden gebracht met de zogenaamde confrontatiematrix. De SWOT-analyse verzorgt dus de input voor de matrix, waarna relevante kenmerken van een organisatie en diens omgeving kunnen worden geconfronteerd. Zo kun je nagaan hoe een organisatie de beschikbare kracht optimaal inzet op de externe uitdagingen, of dat zwakte van de organisatie parten gaan spelen indien de bedreigingen doorzetten?
Kortom, werken de gevonden thema’s op elkaar in en versterken ze elkaar? Of zijn ze niet gerelateerd en kun je ze negeren? In de figuur wordt de structuur van de matrix weergegeven en dient de onderzoeker cel voor cel na te gaan wat de impact is van de confrontaties S1*K1, Z3*K2, S3*B2, etc.